对SIS联锁保护系统中联锁程序的变更、联锁设定值的改变、时间整定值的改变等，需要建立各专业会签及技术负责人批准制度，填写《联锁保护系统变更审批单》。
由于工艺、设备原因需变更SIS联锁保护系统的由生产装置负责办理，由于仪表原因需变更SIS联锁保护系统的由电仪车间负责办理，工艺联锁保护系统，由装置经理负责审核；关键机组等设备的SIS联锁保护系统由设备部主管人员负责审核，主管副总批准，仪表（电仪）专业负责实施。
在执行SIS联锁保护系统作业前，需要办理《联锁保护系统临时作业票》。
由于工艺过程原因需临时停运SIS联锁保护系统，需要由工艺装置负责办理，经生产装置主任同意签字，各车间负责SIS联锁系统投切的专职人员负责实施。由于仪表原因需检修，临时停运SIS联锁保护系统，由仪表专业人员办理，经生产装置主任同意签字后方可进行作业。因以上两种原因临时停运的SIS联锁保护系统，须限期恢复，双方作好备案。
在生产期间，SIS联锁保护系统不允许停用，特殊情况确实需要停用时，需要经主管部门组织相关专业论证，制定相应措施，专业会签，审批，然后办理《联锁保护系统停用审批单》。
由于工艺过程原因的由工艺装置负责办理，由于仪表原因的由仪表负责办理，仪表专业人员执票作业。生产技术部、工艺装置、设备部存档。
新建装置或装置大修后，SIS联锁保护系统的投用；长期停用SIS联锁保护系统的恢复，必须由生产、计控、安环、仪表、电气等相关专业人员逐回路进行检查确认，填写《联锁保护回路试验确认单》后方可投入使用。相关部门、仪表、设备部负责存档。
新增SIS联锁保护系统，需经公司设备管理部向电仪车间下达任务书和图纸、资料，由各装置设备部仪表专业负责执行。
在摘除SIS联锁保护前，需要由生产装置工艺人员制定预案并采取相应措施，并经两名及以上仪表作业人员确认，然后摘除联锁。摘除联锁后要检查确认。
仪表专业人员处理SIS联锁保护系统中的问题时，事先需要确定联锁解除方案，采取可靠措施，对程序进行修改、增删，还必须保证不影响DCS、PLC、SIS的正常运行。对于处理问题过程中涉及的检测仪表、开关、继电器、联锁程序、执行器及其附件等，需要有两人以上确认核实，然后严格按照操作规程进行作业。
问题处理完毕后，在投入联锁保护前，必须由两人以上仪表作业人员核实确认，对有保持记忆功能的回路必须进行复位，经技术人员确认后，在有监护人的情况下，由工艺人员将该回路联锁保护投用，并及时填写《SIS联锁保护系统作业票》。
SIS联锁保护系统的操作开关、按钮均由车间人员操作。
SIS联锁保护系统所用检测元件、逻辑单元、执行元件，必须随装置、机组大检修进行检修、校验。
SIS联锁保护系统仪表、设备及附件等，必须有明显的红色联锁标记；紧急停车按钮、开关，应设防护罩。
根据储备标准和备品配件管理规定，联锁保护系统必须储备足够的备品配件，联锁保护系统的供电系统元器件、一次检测元件、逻辑单元、执行单元仪表等必须按规定的使用周期定期更新。
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